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Hablando especificamente de turbo diesel ..

No, al motor no le va a pasar nada si simplemente le quitas el muffler .. simplemente va a ver mas desahogo, mas sonido del turbo, lower EGT, boost mas rapido .. pero nada mas ..

Osea no tiene consecuencias negativas para el motor ese hecho aislado .. ya que el que controla el nivel de boost es el wastegate, si este esta funcionando bien no hay nada que hacer.

Otra cosa es que en los turbo diesel la cantidad de boost esta directamente relacionada con la cantidad de carga sobre el motor, en relacion con la cantidad de diesel inyectado.