sebastian te comento un problema similar que tenia yo..
no tenia señal negativa en los injectores, revise todo, siguiendo el diagrama llegue a que la mayoria de las eCu necesita la señal del CKP para dar la señal de tierra a los injectores y tambien ocupa como señal complementaria la informacion mandada por el CMP.
yo al igual que tu, cambie el CKP y contunio la falla..
luego de mucho rebuscar me di cuenta que el CKP estaba alejado mas de la cuenta de su rueda dentada por ende no cortaba la señal.
puede que por ahi este tu problema, en los manuales dice a que distancia debe estar ubicado y en algunos casos esta se puede regular, o revisa que no tenga nada como grasa, silicona o alguna cosa que este tapando el sensor o su rueda dentada.
suerte y ojala parta